终浓度 | |
尿素 | 7M |
40% Acr/Bis Solution | 15% |
10×TBE 电泳液 | 1× |
操作步骤(仅供参考):
1. 边摇晃溶液变加入TEMED 和10%过硫酸铵。
2. 再充分摇晃约30秒后迅速灌胶,然后插入样品梳,室温放置30-60分钟等待胶凝固。
3. 将凝胶板放置在电泳装置上后,在上下层分别加入适当量的1×TBE电泳缓冲液。如果不马上使用,需要用湿纸将上样孔端盖住以防凝胶过度干燥。
4. 拔出梳子后用加样枪吸取电泳缓冲液,充分将每个加样孔中未聚合的 Acrylamide/Bis、尿素和气泡吹打出来。
5. 在上样前,预电泳20-30分钟以使多余的过硫酸铵跑出加样孔,同时还可以使凝胶的温度升高(到50℃左右),有利于RNA变性状态。
6. 将miRNA样品与等体积的miRNAon混合,70℃保温2-3分钟后迅速放置在冰上冷却,快速离心半分钟,放冰上待用。miRNA Marker需要每个上样孔用5uL,一块胶最好在两侧各用一个孔上样miRNA Marker。
7. 关电泳仪后开始上样。
8. 重开电泳仪,对13cm×15cm的胶,以20-30mA的电流电泳,直到红色染料移动到凝胶边缘为止;对36cm×45cm 的胶,则以50-60mA的电流电泳,直到红色染料移动到凝胶边缘为止。
9. 染色观察:将凝胶一面的玻璃板揭开,直接用仍然附着在另一玻璃板上的凝胶进行各种染色,包括银染(固定、漂洗、显影和定影等步骤)、EB(每 100 mL 1×TBE 中加 20 uL 10mg/mL 的 EB 溶液)。UV 下观察并拍照。
10. miRNA回收:按上法用 EB 等染料染色后,UV下确定所需要的miRNA条带的位置,切胶后进行胶回收处理。
11. Northern杂交:按上法用 EB 等染料染色后,UV下确定所需要的miRNA条带的位置,切胶后电转移到带正电的尼龙膜上,然后进行杂交处理。
12. 放射自显影:如果miRNA样品电泳前经过同位素标记,则将凝胶一面的玻璃板揭开,用滤纸将附着在另一玻璃板上的凝胶吸附过来,然后包上保鲜膜,真空抽干,然后使胶跟X光片向对进行放射自显影。
注意事项:为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
注:Acr/Bis的终浓度需要根据待分离RNA长度选择(见下表)
6-100 nt 20%
25-150 nt 15%
40-200 nt 12%
60-400 nt 8%
80-500 nt 5%
1000-2000 nt 3.50%
备注:以上数据均来自公开文献, 仅供参考